BLAST (на английски: Basic Local Alignment Search Tool ) – семейство компютърни програми, използвани за търсене на хомолози на протеини или нуклеинови киселини, за които е известна първичната структура (последователност) или неин фрагмент.
С помощта на програмата BLAST, изследователят може да сравни наличната за него последователност с последователности от база данни и да намери последователности на предполагаеми хомолози. BLAST е основен инструмент за молекулярни биолози, биоинформатици и систематици.
Програмата BLAST е разработена от учени Stephen Altschul, Warren Gish, Webb Miller, Eugene Myers, и David J. Lipman в Националния институт по здравеопазване на САЩ и е публикувана в списание Journal of Molecular Biology in 1990.
Класификация на програмните серии BLAST
Семейството програми от серията BLAST е разделено на 5 основни групи:
са предназначени за сравняване на изследваната нуклеотидна последователност с базата данни от секвенирани нуклеинови киселини и техните участъци:
са предназначени за сравняване на изследваната аминокиселинна последователност на даден протеин с наличната база данни за протеини и техните места.
са в състояние да превеждат нуклеотидни последователности в аминокиселинни последователности:
са предназначени за сравняване на изследваната нуклеотидна последователност с базата данни на секвенирания геном на даден организъм (човек, мишка и т.н.).
приложни програми, използващи BLAST:
